1° CARNEVALE DELLA CHIMICA

Vorrei ricordare che è partito il carnevale della chimica, i blogger partecipanti sono veramente tanti! Invito a visitare la pagina del sito chimicare.org dove troverete tutti i link dei blogger partecipanti all'iniziativa!

Nata sul modello dei “carnival of science” anglosassoni e ripresa già dal 2008 sul web di lingua italiana grazie alla geniale intuizione di Claudio Pasqua del portale di divulgazione scientifica Gravità-Zero, l’iniziativa dei carnevali scientifici ha saputo creare già per altre importanti discipline come la Matematica e la Fisica un momento di aggregazione, conoscenza reciproca e condivisione fra coloro che nel nostro Paese (o in giro nel mondo) già si occupavano di comunicazione scientifica per mezzo di quello strumento già ben noto per la sua snellezza e pervasività rappresentato dai web blog. A breve distanza dalla nascita del terzo ed ultimo carnevale scientifico, quello dedicato alla Biodiversità, grazie alla collaborazione fra Gravità-Zero e Chimicare.org, nasce domenica 23 gennaio 2011, il Carnevale della Chimica.

QUANTO E' VECCHIO IL TUO CANCRO?

Titola in questo modo un articolo uscito su Scientific American (How Old is your cancer?).

Un paziente che riceve una diagnosi di cancro al pancreas ha solo un 5% di probabilità di sopravvivere per cinque anni, una prognosi straziante che gli scienziati hanno a lungo faticato a capire.

Scienziati della Johns Hopkins University hanno sequenziato il genoma di sette persone che erano morte per cancro al pancreas in fase ritardata. Le cellule tumorali sono cellule che hanno accumulato molteplici mutazioni, in particolar modo a danno di specifici geni che codificano per proteine di fondamentale importanza nel controllo del corretto ciclo cellulare. Attraverso l'analisi delle cellule tumorali di tali pazienti gli scienziati sono riusciti letteralmente a risalire indietro nel tempo, attraverso modelli matematici e a ricostruire una sorta di albero genealogico delle mutazioni che tali cellule avevano subito.

HO RICEVUTO IL SUNSHINE AWARD!

Stamattina ho ricevuto una e-mail da Moreno ammistratore del blog mygenomix, il quale mi ha consegnato un premio, il Sunshine award!

In realtà più che un vero premio è una catena di Sant’Antonio, però ha il suo scopo, cioè dare visibilità ai blog che leggiamo di più. Fa sempre piacere sapere di essere letti, e che ci siano persone che apprezzino o trovino interessante ciò che uno ha da dire nel suo blog. Anche io citerò  12 blog che leggo più volentieri, e inviterei almeno buona parte dei post che elencherò a non interrompere tale catena!

Poche semplici regole; chi riceve il premio è invitato a:

•Scrivere un post per il premio sul proprio blog

•Passare il premio ad altri 12 blog meritevoli, inserendo i rispettivi link

•Comunicare agli autori l’assegnazione del premio

Dunque ecco l'elenco dei 12 blog che leggo più spesso e a cui assegno il mio sunshine awards 2011:

• Biologia e dintorni
• Ecoblog
• Erba volant
• Gravità zero
• Il chimico impertinente
• jekyll
• Leucophaea
• L'orologiaio miope
• Mahengechromis divagazioni di un cinofilo
• mygenomix
• Science for passion
• Theropoda

CARNEVALE DELLA CHIMICA: LA STRUTTURA DELLE PROTEINE

Le proteine possono essere definite come la concretizzazione dell'informazione genetica, è solo grazie ad esse se le cellule possono funzionare in maniera adeguata,  ne esistono di molteplici tipi con funzionalità differenti: gli enzimi coinvolti nelle reazioni cellulari, le proteine di trasporto come l'emoglobina ecc...

Le proteine sono un vero e proprio miracolo d'ingegneria molecolare; la stabilità delle strutture proteiche è di fondamentale importanza per il loro corretto funzionamento e a farla da padrone nel determinare la giusta conformazione tridimensionale che le proteine devono assumere intervengono specifici legami chimici, in particolare modo legami idrogeno, interazioni idrofobiche, legami covalenti per fare un esempio.

I mattoni "molecolari" con i quali una cellula costruisce le proteine sono molecole note come amminoacidi, le proteine sono costituite da sequenze specifiche di amminoacidi; che ne determinano struttura e funzionalità specifica. Perchè una proteina per funzionare ha bisogno di effettuare uno specifico riiegamento della/e sequenze peptidiche che la compongono? ma soprattutto perchè una conformazione nativa di una proteina è preferita ad un altra?

IL CARNEVALE DELLA CHIMICA

Il giorno 16 gennaio parte il carnevale della chimica, iniziativa promossa dai blog chimicare.org e gravità zero. In occasione dell’anno 2011 decretato dall’ONU “Anno Internazionale della Chimica” l'iniziativa ha lo scopo di promuovere la comprensione della chimica rivolgendosi al grande pubblico.
Al seguente link trovate il bando di partecipazione: bando carnevale della chimica.

IL TEST DI AMES

Il test di Ames è un test biologico ampiamente utilizzatoper determnare se un composto è carcinogeno (in grado di induerre formazione di tumori). Il test ideato da Bruce Ames si basa sulla capacità di un carcinogeno di essere mutante, inducendo una mutazione revertante in un microrganismo che sarà utilizzato nell'esperimento.

CHAPERON MOLECOLARI

Le proteine sono costituite da un insieme di molecole piàù piccole note come amminoacidi, una specifica sequenza di amminoacidi farà si che la futura proteina possa assumere una specifica struttura e funzionalità. L'assemblamento dei vari amminoacidi è effettuato da complessi molecolari noti come ribosomi, la sequenza amminoacidica formata Le proteine, però, vengono sintetizzate nei ribosomi semplicemente legando uno all'altro in sequenza i vari amminoacidi e quindi inizialmente sono costituite da catene prive di una precisa forma tridimensionale. La maggior parte delle catene proteiche si avvolge poi spontaneamente per assumere la struttura finale, le proteine tendono a ripiegarsi in modo tale da evitare ch le catene laterali degli amminoacidi apolari entrino a contatto con l'ambiente acquoso della cellula. Non tutte le porteine riescono a ripiegarsi spontaneamente, alcune sono costituite da centinaia di amminoacidi e devono essere aiutate a ripiegarsi correttamente. la specifica sequena di amminoacid come dicevamo è importante per permettere alla protena di ripiegarsi in una specifica conformazione e assumere così una specifica funzionalità. Se il ripiegamento non avviene correttamente la funzionalità viene a mancare, o può essere modificata con conseguenze deleterie per la cellula.

IL CARNEVALE DELLA BIODIVERSITA'

Oggi 15 dicembre 2010 è partito il carnevale della biodiversità. Invito chiunque legga questo post a recarsi sul blog L'orologiaio miope, che in questa prima tornata ospiterà l'evento, dove troverete la lista dei post partecipanti al proggetto. I vari blogger parlano delle infinite forme bellissime che troviamo in natura. La prossima tornata, 12 febbraio 2010, sarà ospitata dal blog Leucophaea e avrà come tema "la lotta costante per il cibo e lo spazio”.

IL BATTERIO CHE SFRUTTA L'ARSENICO

Eccolo, nell'immagine a lato,  il batterio che di se ha fatto tanto parlare in questi giorni. Innanzitutto bisogna dire che tutti gli organismi per funzionare adeguatamente, devono continuamente costruire nuovi componenti celluari e per farlo devono avere a disposizione un preciso gruppo di elementi. Sono noti anche come macroelementi o macronutrienti, perchè i microrganismi, ma il discorso vale anche noi, ne abbisognano in quantità veramente elevate, sono gli elementi che rendono possibile la sintesi di carboidrati, lipidi, proteine, acidi nucleici ecc...gli elementi sono carbonio (C), idrogeno (H), azoto (N), ossigeno (O), zolfo (S), fosforo (P). Ce ne sono anche altri, per lo più ioni, ma questi sei elementi rappresentano lo scheletro di tutte le molecole organiche. Attraverso questa scoperta dicono gli scienziati, nonostante questi elementi siano i mattoni della materia vivente, è teoricamente possibile che altri elementi che ritroviamo sulla tavola periodica possano essere utilizzati efficacemente allo stesso modo.

LA TOPOISOMERASI E IL SUPERAVVOLGIMENTO DEL DNA.

Ognuna delle nostre cellule contiene circa 2 metri di DNA, tutto ripiegato all'interno del nucleo, che è un milione di volte più piccolo. Ciò richiede un elevato stato di organizzazione strutturale per impacchettare una molecola così grande in uno spazio così piccolo.

A rendere le cose ancora più complicate è la struttura a doppia elica del DNA, infati per far si che la cellula replichi fedelemente le informazioni che essa contiene, i filamenti che la compongono devono essere separati e ciò richiede la rottura dei legami idrogeno che ne consentono la stabilità strutturale. Prima di capire come questo possa avvenire con successo dobbiamo parlare di una importante proprietà del DNA nota come superavvolgimento.

IL CARNEVALE DELLA BIODIVERSITA'

Il 15 Dicembre 2010, a conclusione dell'anno internazionale della biodiversità, partirà un'iniziativa tra i più autorevoli blog italiani che trattano temi legati alle scienze naturali per continuare a sottolineare l'importanza del tema in oggetto, sia all'interno della comunità scientifica sia tra il grande pubblico.

La prima edizione del Carnevale della Biodiversità avrà come tema:
“INFINITE FORME BELLISSIME”


tema che i vari Autori svilupperanno con varie sfaccettature in base ai loro personali stili ed interessi. Il blog “L'orologiaio miope” accoglierà questa prima edizione, passando in rassegna gli articoli scritti dagli altri blogger e segnalandone i link.
I blog partecipanti al progetto sono i seguenti:

•Biosproject: Earth
•Bottiglie di Leida
•Continuo proceso de cambio
•Erba volant
•Gravità zero
•Leucophaea
•L’orologiaio miope
•Mahengechromis Divagazioni di un ciclidofilo
•Oryctes Frammenti di natura
•Paperfish fish biology in progress
•Scientificando
•Theropoda

Il Carnevale della Biodiversità avrà scadenza bimestrale, continuando per tutto il 2011, e sarà ospitato a turno da alcuni dei blog partecipanti.

Il gruppo coordinatore augura buon lavoro a tutti i blog che hanno aderito al progetto e buona lettura a tutti coloro che vorranno partecipare con noi a questo Carnevale.

Livio Leoni, Marco Ferrari, Lisa Signorile

NEURAMINIDASI

Il virus dell'influenza è in continua evoluzione, ogni anno sentiamo parlare di nuovi ceppi, in realtà ogni dieci anni circa, un nuovo ceppo pericoloso appare e costituisce una minaccia per la salute pubblica. L'anno scorso, c'è stato un focolaio di un nuovo ceppo di virus influenzale, l'H1N1, più comunemente noto come virus dell'influenza suina. La denominazione H1N1 si riferisce a due tipi di molecole che ricoprono la superficie del virus: emoagglutinina e neuroaminidasi. Insieme, queste due molecole determino l'infettività del virus. L'emoagglutinina svolge un ruolo determinante quando il virus si avvicina alla cellula legandosi alle catene di polisaccaride sulla superficie cellulare e poi iniettando il DNA virale nella cellula.

La neuraminidasi, d'altra parte, entra in gioco quando il virus abbandona la cellula infettata. Assicura che il virus non resti legato ai polisaccaridi della superficie tagliando le loro catene.

EMOAGGLUTININA

L'influenza è causata da un virus fornito di un rivestimento membranoso, con un genoma costituito da RNA stampo a singolo filamento. Di viru dell'influenza ne esistono tre tipi principali, denominati A,B,C. La differenza principale risiede nelle proteine del nucleocapside.Le caratteistiche principali del capside sono conferit da due proteine che si trovano nei prolungamenti proteici noti come spike. Una è denominata emoagglutinina, l'altro neuraminidasi. La prima rappresenta anche la proteina rincpale presente sulla superficie del virus, è anche il principale sito di aacco da parte degli anticorpi. Inoltre è anche la proteina che mostra maggiore deriva genetica, ed è proprio essa la causa principale del continuo sviluppo di nuovi ceppi, per questo ogni anno ci ritroviamo con nuovi vaccini.