giovedì 5 novembre 2009

SCIENZIATI SI LANCIANO NELL'IMPRESA DI SEQUENZIARE IL DNA DI 10.000 VERTEBRATI


Gli scienziati hanno una nuova ambiziosa strategia per districare la storia evolutiva degli esseri umani e dei loro "parenti" biologici. Creare un archivio genomico fatto dal DNA di circa 10.000 specie di vertebreati, il piano proposto da un consorzio internazionale di scienziati ha lo scopo di ottenere e conservare la sequenza del DNA di almeno una specie di ogni genere di mammiferi, uccelli, anfibi e pesci.
"Capire l'evoluzione dei vertebrati è una delle storie detective più affascinanti della scienza", ha detto David Haussler, che lavora all' Howard Hughes Medical Institute presso la University of California, Santa Cruz (UCSC).
"Nessuno ha mai veramente conosciuto come l'elefante ha la proboscide. Con questo progetto si getteranno le basi per rispondere a queste domande e molte altre."
Conosciuto come il Progetto Genoma 10K, l'iniziativa costerà circa 50 milioni di euro è "proggetto che avrà grandi benefici per la salute umana e animale", ha detto Haussler.
"Nell'arco della nostra vita, avremmo potuto avere un assaggio dei cambiamenti genetici che hanno dato origine ad alcune delle più diverse forme di vita sul pianeta."
Haussler è uno degli autori di un articolo, pubblicato online il 5 novembre 2009, nel Journal of Heredity, che delinea il progetto.
Gli altri autori sono Stephen J. O'Brien, capo del Laboratorio di diversità genomica presso il National Cancer Institute, e Oliver A. Ryder, direttore di genetica presso l'Istituto zoologico di San Diego per la Conservazione della ricerca e professore aggiunto di Biologia presso l' University of California, San Diego.

Coautori e di altri autori, che insieme formano un gruppo chiamato la Comunità Genome 10K di scienziati (G10KCOS), comprendono genetisti, paleontologi, ecologisti, ambientalisti, e altri scienziati che rappresentano giardini zoologici, musei, centri di ricerca e università di tutto il mondo. La proposta nasce in una riunione ospitata presso l'UCSC nel mese di aprile 2009. Più di 50 gli scienziati che si sono riuniti per discutere il merito del progetto e la sue scoraggianti sfide logistiche e finanziarie. "Alcune delle persone nel corso della riunione sono stati inizialmente scettici", ha detto Haussler. "Ma ben presto hanno riconosciuto i numerosi vantaggi di una infrastruttura condivisa e il sistema di analisi dei dati." La spinta principale alla base della proposta è la capacità di rapida espansione del sequenziamento del DNA e la diminuzione dei costi connessi. "Tra poco saremo in una situazione in cui costerà solo qualche migliaio di dollari sequenziare un genoma", ha detto Haussler. "A quel punto, la maggior parte dei costi sarà utilizzata per i campioni, la gestione del progetto, e la manipolazione dei dati." Tutti gli esseri viventi vertebrati discendono da una sola specie marine che hanno vissuto 500-600 milioni di anni fa. I Paleontologi non ne sanno molto, sull'aspetto fisico di tale specie, fatto sta che tutti i suoi discendenti mostrano un certo tipo di caratteristiche comuni, sanno di aver muscoli segmentato, un prosencefalo, mesencefalo e cervello posteriore collegata alle strutture del midollo spinale, e di un sofisticato sistema immunitario innato. I Vertebrati primitivi hanno dato luogo a quello che Haussler chiama "uno dei settori più spettacolari e malleabili della vita".
"I vertebrati hanno colonizzato i mari, conquistato la terra, e poi hanno preso il volo" Nel corso del tempo si sono innovati e perfezionati, ossa e denti, uno scheletro interno che ha sostenuto gli animali acquatici e terrestri più grandi del pianeta, e una specie di primati - Homo sapiens - che ha prodotto un linguaggio sofisticato , cultura, e tecnologia. Attraverso il sequenziamento del DNA di circa 10.000 vertebrati --circa un sesto delle 60.000 specie che si ritiene vivano oggi sul nostro pianeta-- i biologi saranno in grado di ricostruire i cambiamenti genetici che hanno dato origine a questa diversità stupefacente. Alcune parti del nostro DNA sono molto simili al DNA di altri vertebrati, ciò riflette la nostra discendenza da un antenato comune, mentre ltre porzioni sono nettamente diverse. "Possiamo comprendere la funzione degli elementi del genoma umano per vedere quali parti del genoma sono cambiate e quali parti non sono cambiate negli esseri umani e negli altri animali", ha detto Haussler. Il progetto inoltre ha lo scopo di aiutare gli sforzi di conservazione documentando il genoma e la diversità genetica delle specie di vertebrati che sono minacciate o in pericolo. In questo modo si potrà aiutare gli scienziati a prevedere come le specie risponderanno ai cambiamenti climatici, l'inquinamento, le malattie emergenti, e concorrenti invasivi, sosterrà la valutazione, il monitoraggio e la gestione della diversità biologica.

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